改动商铺后门窗户在小区内的位置可能需要经过相关部门的审批和批准。这主要是因为这样的改动可能会影响小区内部建筑安全和公共利益，同时还要考虑安全和便捷性等因素。

根据《住宅室内装饰装修管理办法》中的相关规定，装修人从事住宅室内装饰装修活动，未经批准，不得有下列行为：

1. 搭建建筑物、构筑物。

2. 改变住宅外立面，在非承重外墙上开门、窗。

因此，如果你想改动商铺后门窗户的位置，应该先与业主委员会和物业公司进行沟通和协商，并向小区内规划、建设、消防、安全等部门提交申请，在得到批准后才能进行改动。